Ponad dwadzieścia lat temu doszło do pierwszego kontaktu między obcą cywilizacją a ludzkością. Ludzie oczekiwali przerażającej bitwy lub wielkiego postępu technologicznego. Nic z tego nie wyszło. Obcy byli uchodźcami z ich własnej planety. Stworzenia zostały umieszczone w domach pomocy w Południowej Afryce w Dystrykcie 9, podczas gdy kraje na całym świecie spierały się o to, co robić dalej. Teraz wszystkim kończy się cierpliwość.
Nadzór nad cudzoziemcami powierzono MNU, prywatnej organizacji, której los cudzoziemców jest obojętny. Ale ma perspektywę ogromnych zysków, jeśli uda mu się stworzyć broń obcych, która do aktywacji wymaga obcego DNA. Napięcia między cudzoziemcami i ludźmi dochodzą do głosu, gdy MNU zaczyna przenosić mieszkańców Dystryktu 9 do nowego obozu. Jeden z agentów MNU, Wikus van der Merwe (Sharlto Copley), zostaje zainfekowany obcym wirusem, który zaczyna zmieniać jego DNA. Wkrótce staje się najbardziej poszukiwanym człowiekiem na planecie - kluczem do odkrycia tajemnic technologii obcych. Przerażony mężczyzna ma tylko jedno wyjście: ukryć się w Dystrykcie 9...